Genellikle tam otomatik süreçlere sahip yüksek teknolojili üretim tesisleri, biyokütlenin enerji üretmek için kullanılmasını mümkün kılmaktadır. Bu tesisler doğası gereği pahalıdır ve tam otomatik süreçler ve prosedürler bozulmalara karşı hassastır. 
Fermantasyon ve gaz tankları gaz ve hava karışımı içerdiğinden, tesisin bu kısımları potansiyel patlayıcı olarak sınıflandırılır.

Biyogaz tesislerinin yüksek kullanılabilirliğini ve sorunsuz çalışmasını korumak için yıldırım ve dalgalanmalara karşı güvenilir bir koruma sistemine ihtiyaç vardır.